Nejvyšší správní soud se zabýval otázkou, zda institut náhradního stanovení DPH při nesplnění zákonné registrační povinnosti, tak jak ho obsahoval zákon o DPH ve znění účinném od 1. 4. 2011 do 31. 12. 2012, nemá s ohledem na jeho sankční dopad, povahu trestu, a tudíž je nutné na něj aplikovat zásadu použití pozdější zákonné úpravy, jestliže je to pro daňový subjekt příznivější. Nejvyšší správní soud dospěl k závěru, že na tento institut je nutno nahlížet jako na trestní obvinění, s důsledky s tím souvisejícími.